该校曾获得全国精神文明建设工作先进单位等荣誉称号。
2000年，通过科技事业单位档案管理国家二级的考核，升级为国家二级。
2004年，被评为2003-2004年度"全国青少年科技活动先进集体"。
2005、2006年连续两年获"首都文明单位标兵"称号。
2008年5月，学校钮小桦校长工作室和数学特级教师王文杰工作室获北京市东城区第三届名师、名校长工作室。
2009年，被评为北京市创建学习型学校先进单位。
2011年1月，北京二中金帆舞蹈团在2010年上海世博会总结表彰大会上获"先进集体"称号。
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